El Laboratorio de Criminalística (histología, toxicología, ADN y serología, sustancias controladas, trazas de evidencia, etc.) del Instituto de Ciencias Forenses del Condado de Harris lleva a cabo análisis en las disciplinas forenses de toxicología, biología forense, sustancias controladas, búsqueda y rastreo de pistas y trazas de evidencia.  El Laboratorio de Criminalística está acreditado por la American Society for Crime Laboratory Directors/Laboratory Accreditation Board (ASCLD/LAB), conforme con el Programa Internacional, y por el Departamento de Seguridad Pública de Texas (Texas Department of Public Safety), además de estar acreditado por el American Board of Forensic Toxicology (ABFT).  Además, el Laboratorio de Biología Forense (ADN/serología) cumple totalmente con los requisitos de los estándares de garantía y control de calidad del FBI (FBI Quality Assurance Standards) para laboratorios forenses de pruebas ADN y serología. 

El Laboratorio de Criminalística brinda sus servicios tanto a los patólogos forenses como también a las agencias del orden del Condado de Harris y de los Condados circundantes.  Este laboratorio completó aproximadamente 21.562 casos durante el año 2009, lo que representa un aumento del 14% por sobre el número de casos durante el año 2008.  El Laboratorio de Biología Forense (ADN/serología), en particular, experimentó un incremento del 44% de casos completados.  El Laboratorio de Sustancias Controladas ha mejorado y acortado su tiempo de respuesta finalizando y completando el 90% de los casos dentro de los 10 días de recibidos. 

El Laboratorio de Criminalística continúa invirtiendo en tecnologías nuevas a fin de mejorar sus metodologías e incrementar su productividad.  El Laboratorio incorporó recientemente instrumental LC/MS/MS, Headspace GCMS, GC/MS/MS, y Liquid Chromatography/Time-of-Flight/Mass Spectrometer (LC/TOF/MS).  Los Scanning Electron Microscopes han sido actualizados y modernizados con sistemas más eficientes de detección de rayos-X.  A fin de completar la automatización del proceso de pruebas de ADN, el Laboratorio de Biología Forense adquirió tres nuevos instrumentos robóticos. 

El Laboratorio de Criminalística mantiene un programa de pasantías/prácticas para estudiantes universitarios.  El programa ofrece a los estudiantes la oportunidad de completar un proyecto de investigación en el laboratorio y de familiarizarse con las operaciones y funcionamiento del laboratorio.  Asimismo, el Laboratorio dispone de posiciones para científicos visitantes con experiencia.  Estos científicos tienen la oportunidad de participar en proyectos avanzados de investigación.